根據低聚果糖的生物學效應及其安全研究進展，低聚果糖可以：

Buddington每天補充12名健康受試者4g的低聚果糖FOS，連續26天后，發現大腸中雙歧桿菌和厭氧菌的濃度提高。

中國食品衛生監督檢驗所進行的首次國內人體食品試驗表明，低聚果糖可顯著增加腸道菌群中雙歧桿菌等有益菌的數量（超過12倍），產氣莢膜梭菌等有害菌群的數量顯著減少到原始數量的1/30。

還有低聚果糖的報道FOS腸易激綜合征（irritable bowel syndrome,IBS）治療。這可能是因為低聚果糖FOS增加腸道雙歧桿菌、乳酸菌等有益細菌，抑制外源性和內源性有害微生物的繁殖。

Fiordaliso一周后，血漿甘油三酯、磷脂和膽固醇開始下降，并持續到16周。甘油三酯的下降伴隨著血漿 VLDL 脂蛋白的減少。分離實驗組大鼠肝臟進行體外研究發現，長期攝入10%低聚果糖FOS飼料降低了肝臟合成甘油三酯的能力。

1997年11月，中國食品衛生監督檢驗所證明，低聚果糖FOS它具有降低血脂的功能。徐進等報道添加0.5-2.5g/kg 體重低聚果糖FOS28大鼠血清總膽固醇和甘油三脂的水平可顯著降低。

Williams和Pereire 等低聚果糖報道FOS可顯著降低個體血清甘油三酯水平(分別為19% 和27%)。

Van den Heuvel 用穩定性同位素法對 12歲14-16 年輕人測定15g 低聚果糖FOS對鈣吸收的影響，鈣吸收的百分比來自對照組47.8%(安慰劑)上升到 60.1% (低聚果糖)。因此，飲食低聚果糖可以幫助骨骼鈣化，預防胃切除術后小梁骨和皮質骨退化的骨病。

體外實驗表明，低聚果糖能直接作用于腸粘膜上皮組織，顯著促進鈣的轉移和吸收。

目前認為低聚果糖一方面可以通過提高腸粘膜鈣結合蛋白的水平來促進鈣的吸收。另一方面，難以消化的低聚果糖在腸道內轉化為 L 乳酸，L- 乳酸吸附鈣化合物會增加其溶解度，從而增強鈣的吸收能力。

另一項研究表明，低聚果糖FOS2型糖尿病患者攝入低聚果糖可以改善血糖值FOS可顯著降低空腹血糖 ，給雄性大鼠喂低聚果糖可顯著降低空腹血糖和胰島素水平。因此，它可以作為高血壓、糖尿病和肥胖患者的食物甜味劑。